ניתוח רצפי זמן של RNA-seq מתא בודד — טרנסקריפטומיקה זמנית ברזולוציית תא בודד
ניתוח רצפי זמן של RNA-seq מתא בודד לוכד ביטוי גנים על פני נקודות זמן מרובות ברזולוציית תא בודד כדי לחשוף כיצד אוכלוסיות תאים מופיעות, עוברות שינוי ומתפצלות במהלך תהליכים ביולוגיים דינמיים כגון התפתחות, התמיינות או התקדמות מחלה. על ידי שילוב סדר פסאודו-זמן (pseudotime ordering), מהירות RNA (RNA velocity) ובדיקת דינמיקה דיפרנציאלית, חוקרים משחזרים את המסלול הזמני של תאים בודדים ומזהים את השינויים בוויסות הגנים המניעים מעברים ביולוגיים.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח שונות מספר העתקים (CNV)ביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח eQTLביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)ביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה