ניתוח העשרת מסלולים מבוסס-רשת
ניתוח העשרת מסלולים מבוסס-רשת משלב רשתות אינטראקציה מולקולריות — אינטראקציות חלבון-חלבון, גרפי איתות, או רשתות רגולציה גנטיות — עם מדידות אומיות (omics) כדי לזהות מסלולים ביולוגיים שעברו שינוי קואורדינטיבי במצב נתון. בניגוד לגישות קלאסיות של ייצוג-יתר (over-representation) או העשרת קבוצות גנים (gene-set enrichment) המטפלות בגנים במסלול כרשימות בלתי תלויות, משפחת שיטות זו מפיצה אותות על פני קשרי הרשת, לוכדת את הטופולוגיה של האינטראקציות, וחושפת מודולים שעברו דיסרגולציה (dysregulation) שאותם העשרת רשימות שטוחות תחמיץ.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)ביואינפורמטיקה↔ השוואה