ניתוח שונות במספר עותקים מבוסס-רשת
ניתוח שונות במספר עותקים (CNV) מבוסס-רשת משלב נתוני CNV כלל-גנומיים עם רשתות אינטראקציה ביולוגיות – כגון אינטראקציות חלבון-חלבון (PPI) או רשתות מסלולים – כדי לזהות אזורים קוהרנטיים מבחינה תפקודית, גנים מניעים ותת-רשתות משתנות, שאיתור CNV גולמי לבדו היה מפספס. על ידי הפצת אותות CNV דרך גרף הרשת, השיטה חושפת חוסר איזון מתואם במינון גנומי המתכנס לפונקציות ביולוגיות משותפות, מה שהופך אותה לחזקה במיוחד בגנומיקה של סרטן ובמחקרים של מחלות נדירות.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
מקורות
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ניתוח שונות מספר העתקים (CNV)ביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)ביואינפורמטיקה↔ compare
- GWAS מבוסס-רשתביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי מבוסס-רשת של נתוני RNA-seqביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ compare
- קריאת וריאנטיםביואינפורמטיקה↔ compare