ניתוח ATAC-seq
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) היא שיטה לפרופיל של נגישות הכרומטין ברחבי הגנום. פותחה על ידי בואנרוסטרו ועמיתיו בשנת 2013, ATAC-seq משתמשת בטרנספוזאז היפראקטיבי כדי לתייג אזורי כרומטין פתוחים ונגישים, ומאפשרת זיהוי מהיר ורגיש של אלמנטים רגולטוריים ב-DNA. ATAC-seq הפכה לטכניקה סטנדרטית לאפיון נופים רגולטוריים של גנים, גילוי אלמנטים רגולטוריים ספציפיים לסוג תא, והסקת רשתות רגולטוריות של גנים.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
מקורות
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/he/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
Compare side by side →