ניתוח GWAS של תא בודד — ניתוח אסוציאציות גנטיות ספציפיות לסוג תא
GWAS של תא בודד הוא צינור ביו-אינפורמטיקה אינטגרטיבי הממפה אותות ממחקר אסוציאציות גנום-רחב (GWAS) על גבי נופים טרנסקריפטומיים של תאים בודדים, על מנת לזהות אילו סוגי תאים ותאים בודדים נושאים סיכון גנטי לא פרופורציונלי למחלה או תכונה. על ידי מינוף אטלסים של RNA-seq של תאים בודדים לצד סטטיסטיקות סיכום של GWAS, הוא חורג מאסוציאציות ברמת הרקמה כדי לחשוף את ההקשרים התאיים המדויקים שבהם וריאנטים גנטיים הקשורים למחלה מפעילים את השפעותיהם.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
מקורות
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/single-cell-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ניתוח eQTLביואינפורמטיקה↔ compare
- מחקר השוואתי של כלל הגנום (GWAS)ביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח eQTL של תאים בודדיםביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ compare