Process / pipelineBioinformatics / omics
ניתוח RNA-seq של תא בודד — scRNA-seq
ניתוח ריצוף RNA של תא בודד (scRNA-seq) מאפיין ביטוי גנים ברזולוציה של תאים בודדים, ומאפשר גילוי של סוגי תאים, מצבים ומעברים שאינם נראים בטרנסקריפטומיקה גסה. החל מקריאות ריצוף גולמיות, זרימת העבודה מייצרת מטריצת ספירות תא-מול-גן וממשיכה דרך בקרת איכות, נורמליזציה, הפחתת מימדיות, אשכול בלתי מפוקח, אנוטציה של סוגי תאים, ומגוון ניתוחים במורד הזרם כגון הסקת מסלול וביטוי דיפרנציאלי בין אוכלוסיות תאים.
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
עוד 19+
מקורות
- Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192 ↗
- Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002 ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)ביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח eQTL של תאים בודדיםביואינפורמטיקה↔ השוואה
- קריאת וריאנטים ברזולוציית תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה
מאוזכר על ידי
ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seq בייסיאניקריאת שיאי ChIP-seqניתוח RNA-seq דיפרנציאלי ברמת התא הבודדניתוח eQTLניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)קריאת שיאים (peak calling) בסיוע למידת מכונה לנתוני ChIP-seqניתוח העשרת קבוצות גנים בסיוע למידת מכונהניתוח ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq בסיוע למידת מכונהניתוח RNA-seq של תאים בודדים בסיוע למידת מכונהMulti-omics single-cell RNA-seq analysisניתוח ביטוי דיפרנציאלי מבוסס-רשת של נתוני RNA-seqניתוח RNA-seq חד-תאי מבוסס רשתניתוח העשרת מסלוליםניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqיישור רצפיםקריאת שיאים ב-ChIP-seq של תא בודדניתוח שונות מספר העתקים בתא בודדניתוח eQTL של תאים בודדיםניתוח העשרת קבוצות גנים לתאים בודדיםניתוח GWAS של תא בודדניתוח מטבולומי של תאים בודדיםניתוח גיוון מיקרוביום בתא בודדניתוח פילוגנטי של תאים בודדיםניתוח ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq של תא בודדניתוח העשרת קבוצות גנים בסדרות עתיותניתוח שונות מיקרוביום בסדרות עתיותביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq בסדרות עתיותניתוח רצפי זמן של RNA-seq מתא בודד