קריאת פסגות (peak calling) דיפרנציאלית ב-ChIP-seq — ניתוח השוואתי של קשירת כרומטין

קריאת פסגות דיפרנציאלית ב-ChIP-seq מזהה לוקוסים גנומיים שבהם לחלבון עניין — בדרך כלל פקטור שעתוק (transcription factor) או סימן היסטון (histone mark) — ישנה קשירה או תפוסה (occupancy) שונה באופן מובהק בין שני מצבים ביולוגיים או יותר. על ידי שילוב של זיהוי פסגות ChIP-seq סטנדרטי עם בדיקות סטטיסטיות מבוססות ספירת קריאות (count-based statistical testing), השיטה חושפת אלמנטים רגולטוריים ספציפיים לתנאים, ומספקת מפה בקנה מידה גנומי של אינטראקציות כרומטין דינמיות העומדות בבסיס שינויים במצב התא.