Process / pipelineMetagenomics
בינינג מטא-גנומי
בינינג מטא-גנומי מחלק קונטיגים שעברו הרכבה מקהילות מיקרוביאליות מורכבות למגירות גנום נפרדות, שכל אחת מהן מייצגת אורגניזם או זן בודד. חלוצי השיטה, קבוצתה של בנפילד, מבודדת גנומים של אורגניזמים בודדים (גנומים מורכבים ממטא-גנום או MAGs) מדגימות סביבתיות ללא צורך בתרביות מבודדות.
פתיחה ב-MethodMindבקרובApply, compare, get guidance
Tools & resources
Learn & explore
וידאובקרוב
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. DOI: 10.7717/peerj.1165 ↗
- Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. DOI: 10.1038/s41467-018-07641-9 ↗
- Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. DOI: 10.1038/s41564-018-0171-1 ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Metagenome Assembly and Genome Binning. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/metagenomic-binning
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח מסכי CRISPRביואינפורמטיקה↔ השוואה
- הרכבת טרנסקריפטום דה נובוביואינפורמטיקה↔ השוואה
- חיפוש פרופילים ב-HMMERביואינפורמטיקה↔ השוואה
מאוזכר על ידי
Similar methods
Single-cell Microbiome Diversity AnalysisDe Novo Transcriptome AssemblyMulti-omics microbiome diversity analysiseDNA MetabarcodingMachine learning-assisted microbiome diversity analysisBayesian Microbiome Diversity AnalysisNetwork-based microbiome diversity analysisTime-series microbiome diversity analysis