Process / pipelineSequence homology search
חיפוש פרופילים ב-HMMER
חיפוש פרופילים ב-HMMER מזהה הומולוגים רחוקים של רצפי חלבונים באמצעות מודלים הסתברותיים של משפחות חלבונים, הידועים כמודלי מרקוב חבויים (HMMs) מבוססי פרופיל. שיטה זו, שפותחה על ידי אדי ועמיתיו, לוכדת דפוסי שונות ברצפים בתוך משפחות חלבונים ומאתרת הומולוגים ברגישות גבוהה בהרבה ממטריצות משקל-מיקום או יישור זוגי.
פתיחה ב-MethodMindבקרובApply, compare, get guidance
Tools & resources
Learn & explore
וידאובקרוב
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/hmmer-profile-search
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- שחזור קריו-EMביואינפורמטיקה↔ השוואה
- בינינג מטא-גנומיביואינפורמטיקה↔ השוואה
- עגינה מולקולריתביואינפורמטיקה↔ השוואה