קריאת וריאנטים ברזולוציית תא בודד — זיהוי מוטציות ברזולוציה תאית
קריאת וריאנטים ברזולוציית תא בודד (Single-cell variant calling) היא צינור עיבוד ביו-אינפורמטי (bioinformatics pipeline) המזהה וריאנטים ברצף ה-DNA — וריאנטים של נוקלאוטיד בודד (SNVs), השתלות ומחיקות קטנות, ושינויים במספר העותקים — בתוך תאים בודדים, בניגוד לרקמה שלמה המכילה תערובת תאים. על ידי פירוט נוף המוטציות תא אחר תא, היא חושפת הטרוגניות תוך-גידולית, ארכיטקטורה כלונאלית, ודפוסי מוטציות סומטיות שריצוף רקמה שלמה מטשטש. גישה זו מרכזית בגנומיקה של סרטן, ביולוגיה התפתחותית, וכל מחקר שבו מגוון גנטי מתא לתא הוא השאלה העיקרית.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
מקורות
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ניתוח שונות מספר העתקים (CNV)ביואינפורמטיקה↔ compare