Process / pipelineBioinformatics / omics
קריאת שיאים בסדרת-זמן של ChIP-seq — פרופיל כרומטין זמני
קריאת שיאי ChIP-seq בסדרת-זמן מרחיבה את ניתוח ה-ChIP-seq הסטנדרטי לדגימות שנאספו בנקודות זמן מרובות. על ידי זיהוי והשוואה של שיאי קשירת חלבון-DNA לאורך ציר הזמן, השיטה חושפת כיצד תפוסת גורמי שעתוק, שינויים בהיסטונים, או קשירת משקמי כרומטין מתפתחים במהלך תהליכים ביולוגיים כגון התמיינות, מחזורים צירקדיים, או תגובה לגירויים.
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., ... & Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗
- Haiminen, N., Karlebach, G., Kharchenko, P. V., & Lähdesmäki, H. (2018). TimeChIP: time-series peak calling for ChIP-seq data. Bioinformatics, 34(24), 4161–4167. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/time-series-chip-seq-peak-calling
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח ATAC-seqגנטיקה↔ השוואה
- קריאת שיאי ChIP-seqביואינפורמטיקה↔ השוואה
- מחקר אסוציאציות אפי-גנום-רחב (EWAS)ביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq בסדרות עתיותביואינפורמטיקה↔ השוואה