Process / pipelineBioinformatics / omics
ניתוח שונות מספר העתקים בתא בודד
ניתוח שונות מספר העתקים בתא בודד (scCNV) מזהה הגברות והפסדים של מקטעים גנומיים בתוך תאים בודדים, ומאפשר לחוקרים לפתור הטרוגניות תוך-גידולית, לשחזר אבולוציה שכלית, ולהבחין בין תאים ממאירים לנורמליים ברזולוציית תא בודד. ניתן ליישם זאת על נתוני ריצוף גנום שלם בתא בודד ישירות, או להסיק מתוך אותות עומק קריאה בניסויי scRNA-seq או scATAC-seq.
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח שונות מספר העתקים (CNV)ביואינפורמטיקה↔ השוואה
- מחקר אסוציאציות אפיגנומי-רחב-תאי-יחיד (scEWAS)ביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח GWAS של תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה
- קריאת וריאנטיםביואינפורמטיקה↔ השוואה