GWAS מבוסס-רשת — סקר אסוציאציות גנומי רחב מבוסס-רשת
GWAS מבוסס-רשת משלב תוצאות של סקר אסוציאציות גנומי רחב קונבנציונלי עם נתוני רשת ביולוגית — כגון רשתות אינטראקציית חלבון-חלבון (PPI) או גרפי קו-ביטוי גנים — לזיהוי מודולים גנטיים או תת-רשתות הרלוונטיים למחלה. במקום לדווח רק על וריאנטים בודדים (SNPs) בעלי החשיבות הגבוהה ביותר, גישה זו מפיצה אותות אסוציאציה דרך רשתות אינטראקציה מולקולריות, ומציפה אשכולות גנים שבהם האות הקולקטיבי מצביע עליהם כמעורבים בביולוגיה של תכונות מורכבות, גם כאשר אף וריאנט בודד אינו מגיע למובהקות גנומית לבדו.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
מקורות
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ניתוח שונות מספר העתקים (CNV)ביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח eQTLביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)ביואינפורמטיקה↔ compare
- מחקר השוואתי של כלל הגנום (GWAS)ביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח eQTL מבוסס רשתביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ compare