Process / pipelineSystems biology
טופולוגיית רשת PPI
ניתוח רשתות אינטראקציה בין-חלבונים (Protein-protein interaction, PPI) מזהה ומאפיין את התכונות המבניות של רשתות אינטראקציה תאיות. גישה זו, שחלוציה היו Uetz ועמיתיו באמצעות סינון שתי-היברידי בקנה מידה גדול של שמרים, חושפת מאפיינים טופולוגיים כגון 'האב' (hubs), מודולים ומוטיבים, המקודדים ארגון פונקציונלי וקשרים למחלות.
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/ppi-network-topology
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- שחזור קריו-EMביואינפורמטיקה↔ השוואה
- חיפוש פרופילים ב-HMMERביואינפורמטיקה↔ השוואה
- עגינה מולקולריתביואינפורמטיקה↔ השוואה