Process / pipelineBioinformatics / omics
ניתוח פילוגנטי של תאים בודדים — שחזור עץ שושלת ברזולוציית תא בודד
ניתוח פילוגנטי של תאים בודדים משחזר עצים אבולוציוניים או התפתחותיים מנתוני ריצוף של תאים בודדים, ועוקב אחר האופן שבו תאים בודדים התפצלו מאב קדמון משותף. על ידי מינוף מוטציות סומטיות, ברקודים שהוכנסו באמצעות CRISPR, או שינויי מספר עותקים כמאפיינים תורשתיים, שיטה זו ממפה קשרי שיבוט (קלונליות) בתוך גידולים, רקמות מתפתחות או מאגרי חיסון ברזולוציה תאית חסרת תקדים.
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח שונות מספר העתקים (CNV)ביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח פילוגנטיביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה
- קריאת וריאנטיםביואינפורמטיקה↔ השוואה