Process / pipelineBioinformatics / omics
ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)
ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA) הוא שיטה חישובית הקובעת האם קבוצת גנים מוגדרת מראש – המייצגת מסלול ביולוגי, תהליך או פונקציה – מציגה הבדלים מתואמים ומשמעותיים סטטיסטית בין שני מצבים ביולוגיים. בניגוד לסינון פשוט לפי שינוי קיפול, GSEA פועלת על כל הגנים הנמדדים המדורגים לפי מדד קורלציה, ומזהה שינויים עדינים אך עקביים לאורך מסלול שלם, גם כאשר אף גן בודד אינו עובר סף מובהקות.
פתיחה ב-MethodMindבקרובApply, compare, get guidance
Tools & resources
Learn & explore
וידאובקרוב
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
עוד 27+
מקורות
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח העשרת קבוצות גנים מרובות-אומיתסביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח העשרת קבוצות גנים מבוסס-רשתביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה
מאוזכר על ידי
ניתוח העשרת קבוצות גנים בייסיאניניתוח בייסיאני של מגוון המיקרוביום – הערכה הסתברותית של מבנה הקהילהניתוח העשרת מסלולים בייסיאניניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seq בייסיאניקריאת פסגות (peak calling) דיפרנציאלית ב-ChIP-seqניתוח העשרה דיפרנציאלי של מסלוליםניתוח eQTLניתוח העשרת קבוצות גנים בסיוע למידת מכונהניתוח העשרת מסלולים בסיוע למידת מכונהניתוח ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq בסיוע למידת מכונהניתוח RNA-seq של תאים בודדים בסיוע למידת מכונהניתוח מטבולומיקהניתוח העשרת קבוצות גנים מרובות-אומיתסניתוח מטבולומי רב-אומי (Multi-omics Metabolomics Analysis)ניתוח שונות מיקרוביום רב-אומיתניתוח העשרת מסלולים רב-אומיייםניתוח פרוטאומיקה רב-אומיתניתוח ביטוי דיפרנציאלי בריצוף RNA רב-אומייMulti-omics single-cell RNA-seq analysisניתוח שונות במספר עותקים מבוסס-רשתניתוח העשרת קבוצות גנים מבוסס-רשתGWAS מבוסס-רשתניתוח מטבולומי מבוסס-רשתניתוח גיוון מיקרוביום מבוסס-רשתניתוח העשרת מסלולים מבוסס-רשתניתוח ביטוי דיפרנציאלי מבוסס-רשת של נתוני RNA-seqניתוח RNA-seq חד-תאי מבוסס רשתניתוח העשרת מסלוליםניתוח פרוטאומיניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqניתוח העשרת קבוצות גנים לתאים בודדיםניתוח RNA-seq של תא בודדניתוח ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq של תא בודדניתוח העשרת קבוצות גנים בסדרות עתיותניתוח העשרת מסלולים בזמן-סדרהביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq בסדרות עתיותניתוח רצפי זמן של RNA-seq מתא בודד
Similar methods
Pathway Enrichment AnalysisBayesian Gene Set Enrichment AnalysisMulti-omics gene set enrichment analysisNetwork-based gene set enrichment analysisMachine learning-assisted gene set enrichment analysisDifferential pathway enrichment analysisBayesian Pathway Enrichment AnalysisTime-series gene set enrichment analysis