Process / pipelineBioinformatics / omics
ניתוח שונות מיקרוביום בסדרות עתיות — ניתוח שונות מיקרוביום אורכי
ניתוח שונות מיקרוביום בסדרות עתיות עוקב אחר שינויים בעושר, בשוויון ובהרכב הקהילה של אוכלוסיות מיקרוביאליות לאורך נקודות זמן מרובות אצל אותם נבדקים. על ידי שילוב מדדי שונות סטנדרטיים עם מודלים סטטיסטיים אורכיים, הוא מפריד דינמיקה עתית אמיתית משונות בין-אישית, ומזהה מתי וכיצד הפרעות כגון שינויים תזונתיים, טיפול אנטיביוטי או הופעת מחלה מעצבים מחדש את המיקרוביום.
פתיחה ב-MethodMindבקרובApply, compare, get guidance
Tools & resources
Learn & explore
וידאובקרוב
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח שונות מיקרוביום רב-אומיתביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq בסדרות עתיותביואינפורמטיקה↔ השוואה
Similar methods
Bayesian Microbiome Diversity AnalysisMulti-omics microbiome diversity analysisMachine learning-assisted microbiome diversity analysisTime-series metabolomics analysisNetwork-based microbiome diversity analysisTime-series Epigenome-wide Association StudySingle-cell Microbiome Diversity AnalysisTime-series RNA-seq differential expression