מבחן HKA
מבחן הדסון-קרייטמן-אגואה (HKA) הוא שיטה סטטיסטית הבודקת אבולוציה ניטרלית על ידי השוואת רמות הפולימורפיזם בתוך-אוכלוסייה והדיברגנציה בין-אוכלוסיות במספר לוקוסים. המבחן, שפותח על ידי הדסון, קרייטמן ואגואה ב-1987, משתמש בעקרון שלפיו לוקוסים ניטרליים אמורים להראות יחסים צפויים בין פולימורפיזם לדיברגנציה. לוקוסים החורגים מיחסים אלו הם מועמדים לברירה (selection). מבחן HKA שימושי במיוחד לזיהוי ברירה בסקרים על פני הגנום כולו, מכיוון שהוא משתמש בהשוואות יחסיות בין לוקוסים במקום לדרוש כיול חיצוני.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
מקורות
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/he/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- תאוריית הקואלסנציהגנטיקה↔ compare
- סטטיסטיקות F (FST)גנטיקה↔ compare
- מבחן מקדונלד-קרייטמןגנטיקה↔ compare
- סלקציה סוחפת (D של טאג'ימה)גנטיקה↔ compare