Process / pipelineBioinformatics / omics
ניתוח העשרת קבוצות גנים לתאים בודדים — scGSEA
ניתוח העשרת קבוצות גנים לתאים בודדים (scGSEA) מרחיב את ניתוח ה-GSEA הקלאסי לרזולוציית תא בודד. במקום לבדוק אם קבוצת גנים מועשרת בהשוואה ברמת הדגימה, scGSEA מקצה ציון העשרה או פעילות לכל תא, ומאפשר לחוקרים למפות את פעילות המסלול (pathway) על פני אוכלוסיות תאים הטרוגניות, מצבי תא, ומסלולי התפתחות הנתפסים בנתוני RNA-seq מתא בודד.
פתיחה ב-MethodMindבקרובApply, compare, get guidance
Tools & resources
Learn & explore
וידאובקרוב
קראו את השיטה במלואה
לחברים בלבד
התחברותהתחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)ביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ השוואה
מאוזכר על ידי
Similar methods
Gene Set Enrichment AnalysisBayesian Gene Set Enrichment AnalysisDifferential pathway enrichment analysisBayesian Pathway Enrichment AnalysisNetwork-based gene set enrichment analysisTime-series gene set enrichment analysisPathway Enrichment AnalysisMachine learning-assisted gene set enrichment analysis