ניתוח RNA-seq חד-תאי מבוסס רשת
ניתוח RNA-seq חד-תאי מבוסס רשת מרחיב זרימות עבודה סטנדרטיות של scRNA-seq על ידי בנייה ותשאול של רשתות אינטראקציה מולקולריות – רשתות ויסות גנים, רשתות קו-ביטוי, או גרפים של תקשורת בין-תאית – מנתוני טרנסקריפטום חד-תאיים. במקום להתייחס לכל גן באופן עצמאי, גישה זו לוכדת את הפעילות המתואמת של מעגלי גנים ומסלולי איתות בין-תאיים בתוך אוכלוסיות תאים וביניהן, ומאפשרת תצוגה ברמת מערכת של ויסות תעתיקי ברזולוציה חד-תאית.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
מקורות
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)ביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי מבוסס-רשת של נתוני RNA-seqביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח eQTL של תאים בודדיםביואינפורמטיקה↔ compare
- ניתוח RNA-seq של תא בודדביואינפורמטיקה↔ compare