ScholarGate
Assistent

Yapay Zekâ

112 meetodit selles perekonnas.

Esiletõstetud

Lugemisteekond

Selle teema enim viidatud alusmeetodid nende väljatöötamise järjekorras — koht, kust alustada, kui oled siin uus.

  1. Kopiarvu variatsiooni analüüs1998–2006autor Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
  2. Teede rikastumise analüüs2003–2005autor Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
  3. Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)autor Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
  4. Genoomiassotsieerimis-uuring (GWAS)2005–2007autor Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
  5. Epigenome-Wide Association Study (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)autor Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
  6. RNA-seq diferentsiaalne ekspressioon2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)autor Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
  7. Üherakulise RNA sekveneerimise analüüs2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016autor Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
  8. Variant Calling2009–2010 (modern high-throughput era)autor Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)
kõik selle riiuli meetodid ↓

Kõik meetodid 112

SegunemianalüüsEsivanemate seisundi rekonstruktsioonATAC-seq analüüsChIP-seq Peak CallingKoalesentste teooriaKopiarvu variatsiooni analüüsCRISPR-i sõelanalüüsKrüoelektronmikroskoopia (krüo-EM)De novo transkriptoomi kokkupanekDiferentsiaalne ChIP-seq piikide kutsumineDiferentsiaalne koopiaarvukuse variatsiooni analüüsDiferentsiaalne epigenoom-laiune assotsiatsiooniuuringDiferentsiaalne eQTL-analüüsDiferentsiaalne metaboloomika analüüsDiferentsiaalne rajajärjestuse rikastumise analüüsDiferentsiaalproteoomika analüüsDiferentsiaalne üksikrakkude RNA-seq analüüsDiferentsiaalne variandi tuvastamineEpigenome-Wide Association Study (EWAS)Epigenoomi-laiused assotsiatsiooniuuringud haridusuuringuteseQTL analüüsF-statistika (FST)GCTAGenikogude rikastumise analüüs (GSEA)Genoomiassotsieerimis-uuring (GWAS)Genoomiassotsieerimisuuring haridusuuringutesHi-C analüüsHKA testHMMER profiili otsingHomoloogia modelleerimineIBD-kaardistamineLD-blokkide analüüsMasinõppimisega abistatud ChIP-seq piikide kutsumineMasinõppimisega abistatud koopiaarvukuse variatsiooni analüüsMasinõppega toetatud epigenoomiülene assotsiatsiooniuuring (ML-EWAS)Machine learning-assisted expression quantitative trait loci analysisMasinõppimisega abistatud geenikomplekti rikastamise analüüsMasinõppepõhine GWASMasinõppega toetatud metaboloomika analüüsMasinõppimisega abistatud mikrobioomi diversiteedi analüüsMasinõppimisega abistatud rajaprofiili analüüsMasinõppel põhinev fülogeneetiline analüüsMasinõppe abil juhitav RNA-seq diferentsiaalavaldise analüüsMasinõppimisega abistatud järjestuste joondamineMasinõppimisega abistatud üksikrakkude RNA-seq analüüsMasinõppel põhinev variandi tuvastamineMcDonald-Kreitmani testMetaboloomika AnalüüsMetagenoomne binningMolekulaarne dokkimineMitmeoomika epigenoomi-laiusega assotsiatsiooniuuringMulti-omics eQTL analysisMulti-omics Gene Set Enrichment AnalysisMulti-omics metabolomics analysisMitme oomika mikrobioomi mitmekesisuse analüüsMitmeomika rajajoonise rikastuse analüüsMulti-omika fülogeneetiline analüüsMulti-oomika proteoomika analüüsMitme omika andmete RNA-seq diferentsiaalse ekspressiooni analüüsMitme omiksitehnoloogia üksikrakkude RNA-seq analüüsVõrgustikupõhine koopiaarvuse variatsiooni analüüsVõrgustikupõhine epigenoomi laiusega assotsiatsiooniuuring (Network EWAS)Võrgustikupõhine eQTL-analüüsVõrgustikupõhine GWASVõrgustikupõhine metaboloomika analüüsVõrgustikupõhine mikrobioomi mitmekesisuse analüüsVõrgustikupõhine rajateede rikastuse analüüsVõrgupõhine füloloogiline analüüsVõrgustikupõhine RNA-seqi diferentsiaalse ekspressiooni analüüsVõrgupõhine üksikrakkude RNA-seq analüüsVõrgupõhine variantide kutsumineTeede rikastumise analüüsFarmakofoorimudelite loomineFülogeneetiline analüüsFülogeneetilised sõltumatud kontrastidPolügeenne riskiskoorPPI võrgu topoloogiaProteoomika analüüs – massispektromeetria-põhine valkude profiilianalüüsQSARKvantitatiivsete tunnuste lokkuste (QTL) kaardistamineRNA kiirusRNA-seq diferentsiaalne ekspressioonValikulise pühkimise test (Tajima D)Järjestuste joondamineSingle-cell ChIP-seq peak callingÜksikrakkude koopiaarvukuse variatsiooni analüüsÜhe-raku epigeneetika-laiaulatuslik assotsiatsiooniuuring (scEWAS)Ühe-raku eQTL analüüsÜhe raku geenikomplekti rikastumise analüüsSingle-cell GWASÜksikrakulise metaboloomika analüüsÜksikrakkude mikrobioomi mitmekesisuse analüüsÜksikrakuline füllogeneetiline analüüsÜherakulise RNA sekveneerimise analüüsSingle-cell RNA-seq differential expressionSingle-cell Sequence AlignmentGenoomi üksikute rakkude tasemel mutatsioonide tuvastamineAjakohaline ChIP-seq tippude kutsumineAegridade koopiainfo variatsiooni analüüsAegrid EWAS (time-series Epigenome-wide Association Study)Aegrid-eQTL analüüsAegridade geenikomplekti rikastamise analüüsAja-seeria metaboloomika analüüsAegridade mikroobikoosluste analüüsAegridade rajaprognooside analüüsAegrea fülogeneetiline analüüsAegridade proteoomika analüüsAegridade RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonAegridadega üksikrakkude RNA-seq analüüsAegridade muutuste tuvastamineTransmissiooni tasakaalutuse testVariant Calling

Veel rubriigis Eluteadused