Võrgustikupõhine rajateede rikastuse analüüs
Võrgustikupõhine rajajoonte rikastuse analüüs integreerib molekulaarse interaktsiooni võrgustikke – valk-valk interaktsioone, signaalvoogude graafe või geeniregulatsiooni võrgustikke – omiksmõõtmistega, et tuvastada bioloogilisi rajajooni, mis on koordinaatselt muutunud teatud seisundis. Erinevalt klassikalistest üleesindatuse või geenikomplekti rikastuse lähenemisviisidest, mis käsitlevad rajajoonte geene sõltumatute loeteludena, levitab see meetodite perekond signaale mööda võrgustiku servi, haarates interaktsioonide topoloogiat ja paljastades düsreguleeritud mooduleid, mida tasapinnaliste loetelude rikastus jälgimata jätaks.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)Bioinformaatika↔ võrdle
Sellele viitavad
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →