Process / pipelineBioinformatics / omics

Teede rikastumise analüüs — Bioloogilise tee rikastumise analüüs

Teede rikastumise analüüs (PEA) on statistiline lähenemisviis, mis võtab huvipakkuvate geenide või valkude loendi — tavaliselt saadud diferentsiaalse ekspressiooni või proteoomika eksperimendist — ja tuvastab, millised eelnevalt määratletud bioloogilised teed või funktsionaalsed geenikomplektid on esindatud sagedamini kui juhuslikult oodatav. Üksikute molekulaarsete muutuste kaardistamisega kureeritud tee teadmusbaasidesse nagu KEGG, Gene Ontology või Reactome, teisendab PEA pikkade geeniloendite tõlgendatavateks bioloogilisteks protsessideks, muutes selle kesksel tööriistaks kõrge läbilaskevõimega oomikaeksperimentide järelanalüüsil.

Ava rakenduses MethodMindPeagiVideoPeagiLaadi slaidid alla

Loe meetodi täielikku kirjeldust

Ainult liikmetele

Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.

Logi sisse

Meetodikaart

Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.

Teede rikastumise analüüs

Genikogude rikastumise a…Metaboloomika Analüüs Võrgustikupõhine rajatee…Proteoomika analüüs – ma…RNA-seq diferentsiaalne…Üherakulise RNA sekvenee…Bayesian ChIP-seq Peak C…Bayesian eQTL analüüs Bayesian Gene Set Enrich…Bayes'i GWS

+43 veel

Allikad

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Kuidas sellele lehele viidata

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Milline meetod?

Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.

Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)Bioinformaatika↔ võrdle
Metaboloomika AnalüüsBioinformaatika↔ võrdle
Võrgustikupõhine rajateede rikastuse analüüsBioinformaatika↔ võrdle
Proteoomika analüüs – massispektromeetria-põhine valkude profiilianalüüsBioinformaatika↔ võrdle
RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonBioinformaatika↔ võrdle
Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle

Võrdle kõrvuti →

Sellele viitavad

Bayesian ChIP-seq Peak Calling Bayesian eQTL analüüs Bayesian Gene Set Enrichment Analysis Bayes'i GWS Bayesian Metaboloomika Analüüs Bayes' meetodite põhjal rajanev rajajoonte rikastumise analüüs Bayesian Proteomics Analysis Bayesian RNA-seq Differential Expression Diferentsiaalne epigenoom-laiune assotsiatsiooniuuring Diferentsiaalne eQTL-analüüs Diferentsiaalne metaboloomika analüüs Diferentsiaalne rajajärjestuse rikastumise analüüs Diferentsiaalproteoomika analüüs Epigenome-Wide Association Study (EWAS)eQTL analüüs Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)Genoomiassotsieerimis-uuring (GWAS)Machine learning-assisted expression quantitative trait loci analysis Masinõppimisega abistatud geenikomplekti rikastamise analüüs Masinõppimisega abistatud mikrobioomi diversiteedi analüüs Masinõppe abil juhitav RNA-seq diferentsiaalavaldise analüüs Masinõppimisega abistatud üksikrakkude RNA-seq analüüs Metaboloomika Analüüs Mitmeoomika epigenoomi-laiusega assotsiatsiooniuuring Multi-omics Gene Set Enrichment Analysis Multi-omics metabolomics analysis Mitme oomika mikrobioomi mitmekesisuse analüüs Multi-oomika proteoomika analüüs Mitme omiksitehnoloogia üksikrakkude RNA-seq analüüs Võrgustikupõhine koopiaarvuse variatsiooni analüüs Võrgustikupõhine epigenoomi laiusega assotsiatsiooniuuring (Network EWAS)Võrgustikupõhine eQTL-analüüs Võrgupõhine geenikomplekti rikastumise analüüs Võrgustikupõhine GWAS Võrgustikupõhine metaboloomika analüüs Võrgustikupõhine mikrobioomi mitmekesisuse analüüs Võrgustikupõhine RNA-seqi diferentsiaalse ekspressiooni analüüs Võrgupõhine üksikrakkude RNA-seq analüüs Proteoomika analüüs – massispektromeetria-põhine valkude profiilianalüüs RNA-seq diferentsiaalne ekspressioon Ühe-raku eQTL analüüs Ühe raku geenikomplekti rikastumise analüüs Single-cell GWAS Üksikrakulise metaboloomika analüüs Üherakulise RNA sekveneerimise analüüs Single-cell RNA-seq differential expression Aegridade geenikomplekti rikastamise analüüs Aja-seeria metaboloomika analüüs Aegridade mikroobikoosluste analüüs Aegridade rajaprognooside analüüs Aegridade RNA-seq diferentsiaalne ekspressioon Aegridadega üksikrakkude RNA-seq analüüs

Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →