Genoomi üksikute rakkude tasemel mutatsioonide tuvastamine — mutatsioonide tuvastamine raku resolutsiooniga
Genoomi üksikute rakkude tasemel mutatsioonide tuvastamine on bioinformaatika töövoog, mis identifitseerib DNA järjestuse variatsioone — üksiknukleotiidsed variatsioonid (SNV), väikesed insertsioonid ja deletsioonid ning koopiaarvukuse muutused — üksikutes rakkudes, mitte aga kogu koemassi segus. Mutatsioonimaastiku rakuhaaval lahendamine paljastab kasvaja sisese heterogeensuse, kloonide arhitektuuri ja somaatilised mutatsioonimustrid, mida kogu sekveneerimine varjab. See lähenemisviis on kesksel kohal vähi genoomikas, arengubioloogias ja mis tahes uuringutes, kus rakuvaheline geneetiline mitmekesisus on peamine küsimus.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Allikad
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Kopiarvu variatsiooni analüüsBioinformaatika↔ compare
Sellele viitavad
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →