ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Aegridade muutuste tuvastamine — pikisuunnaline somaatiliste mutatsioonide tuvastamine

Aegridade muutuste tuvastamine on bioinformaatika töövoog, mis tuvastab ja jälgib genoomseid muutusi – tavaliselt somaatilisi mutatsioone – mitmete sama uuritava isiku erinevatel ajahetkedel kogutud sekveneerimisproovide kaudu. Seda rakendatakse kõige laialdasemalt vähi genoomikas kasvajate evolutsiooni rekonstrueerimiseks, minimaalse jääkhaiguse jälgimiseks ja raviresistentsete kloonide tekke tuvastamiseks. Muutuste alleelsete sageduste ajalisel mõõtmel ühine modelleerimine eristab tõelisi somaatilisi muutusi sekveneerimisest tingitud müra hulgast ja hindab kloonide dünaamikat aja jooksul.

Ava rakenduses MethodMindPeagiVideoPeagiLaadi slaidid alla

Loe meetodi täielikku kirjeldust

Ainult liikmetele

Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.

Logi sisse

Meetodikaart

Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.

Aegridade muutuste tuvastamine
RNA-seq diferentsiaalne…

Allikad

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link ↗
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link ↗

Kuidas sellele lehele viidata

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/time-series-variant-calling

Milline meetod?

Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.

Võrdle kõrvuti →

Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →

ScholarGate — Time-series variant calling (Time-series Variant Calling). Loetud 2026-06-15 aadressilt https://scholargate.app/et/bioinformatics/time-series-variant-calling · Andmestik: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026