RNA kiirus
RNA kiirus on arvutusmeetod, mis ennustab üksikute rakkude tulevast arengustaadiumit üksik-RNA-sekveneerimise andmete põhjal. La Manno ja kolleegide poolt 2018. aastal välja töötatud RNA kiiruse analüüs mõõdab rakkude seisundi üleminekute suunda ja kiirust, analüüsides splaissimata ja splaissitud mRNA transkriptide suhet üksikutes rakkudes. See võimaldab ennustada rakkude trajektoore ja diferentseerumisradasid ilma ajaliselt järjestatud proovivõtu või manipuleerimiseta, pakkudes unikaalset ülevaadet rakkude saatuse otsustest arengu ja haiguste ajal.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/et/genetics/rna-velocity
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- ATAC-seq analüüsGeneetika↔ võrdle
- Hi-C analüüsGeneetika↔ võrdle
Sellele viitavad
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →