Võrgupõhine üksikrakkude RNA-seq analüüs
Võrgupõhine üksikrakkude RNA-seq analüüs laiendab standardseid scRNA-seq töövooge, konstrueerides ja uurides molekulaarsete interaktsioonide võrgustikke – geeniregulatoorseid võrgustikke, koekspressioonivõrgustikke või rakudevahelisi kommunikatsioonigraafe – üksikrakkude transkriptoomika andmetest. Selle asemel, et käsitleda iga geeni sõltumatult, püüab see lähenemisviis kinni geeniringkondade ja rakudevaheliste signaaliradade koordineeritud aktiivsuse rakkude populatsioonide sees ja vahel, võimaldades süsteemitasemel vaadet transkriptsiooniregulatsioonile üksikrakkude resolutsiooniga.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)Bioinformaatika↔ võrdle
- Võrgustikupõhine RNA-seqi diferentsiaalse ekspressiooni analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Teede rikastumise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonBioinformaatika↔ võrdle
- Ühe-raku eQTL analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →