Mitme omiksitehnoloogia üksikrakkude RNA-seq analüüs — integreeriv multimodaalne üksikrakkude profileerimine
Mitme omiksitehnoloogia üksikrakkude RNA-seq analüüs integreerib kaks või enam molekulaarset kihti — nagu geeniekspressioon (scRNA-seq), kromatiini kättesaadavus (scATAC-seq) või pinnavalkude hulk (CITE-seq) — mida mõõdetakse samaaegselt või profileeritakse samades üksikrakkudes. Neid modaalsusi jagatud madaladimensioonilises ruumis sidudes saavad teadlased rakutüübi, regulatoorse seisundi ja fenotüübi kohta mehhanistlikult rikkama pildi kui mis tahes üksikanalüüs seda võimaldaks.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link ↗
- Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- ChIP-seq Peak CallingBioinformaatika↔ võrdle
- Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)Bioinformaatika↔ võrdle
- Mitme omika andmete RNA-seq diferentsiaalse ekspressiooni analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Teede rikastumise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonBioinformaatika↔ võrdle
- Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →