Üksikrakuline füllogeneetiline analüüs — liinitüvede rekonstrueerimine üksikrakulisel tasemel
Üksikrakuline füllogeneetiline analüüs rekonstrueerib evolutsioonilisi või arengulisi tüvesid üksikrakulise järjestusandmete põhjal, jälgides, kuidas üksikrakud on ühisest esivanemast erinenud. Somaatiliste mutatsioonide, CRISPR-iga sisestatud bar-koodide või koopiaarvumuutuste kasutamisel pärilike tunnustena kaardistab see meetod kloonaalseid suhteid kasvajates, arenevates kudedes või immuunrepertuaarides enneolematu rakuresolutsiooniga.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- Kopiarvu variatsiooni analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Fülogeneetiline analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Variant CallingBioinformaatika↔ võrdle
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →