Diferentsiaalne koopiaarvukuse variatsiooni analüüs — Võrdlev CNV / SCNA analüüs
Diferentsiaalne koopiaarvukuse variatsiooni (dCNV) analüüs tuvastab genoomseid piirkondi, kus DNA koopiaarvud erinevad süstemaatiliselt kahe seisundi vahel — näiteks kasvaja versus normaalne kude, juhtum versus kontrollkohordid või töödeldud versus töötlemata rakud. Kombineerides sonditaseme loendussügavuse või massiivi intensiivsuse andmeid statistilise segmentatsiooni ja rühmataseme testimisega, tuvastab see somaatilised amplifikatsioonid ja deletsioonid, mis võivad haigust põhjustada, ning eristab korduvad juhi-sündmused reisijamürast kogu kohordis.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
- Mermel, C. H., Schumacher, S. E., Hill, B., Meyerson, M. L., Beroukhim, R., & Getz, G. (2011). GISTIC2.0 facilitates sensitive and confident localization of the targets of focal somatic copy-number alteration in human cancers. Genome Biology, 12(4), R41. DOI: 10.1186/gb-2011-12-4-r41 ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/differential-copy-number-variation-analysis
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- Genoomiassotsieerimis-uuring (GWAS)Bioinformaatika↔ võrdle
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →