Aegridade mikroobikoosluste analüüs — pikisuunaliste mikroobikoosluste analüüs
Aegridade mikroobikoosluste analüüs jälgib, kuidas mikroobikoosluste rikkus, ühtlus ja kogukonna koostis muutuvad mitmes ajapunktis samade subjektide puhul. Standardsete mitmekesisusnäitajate ja pikisuunalinete statistiliste mudelite kombineerimisel eraldatakse tõelised ajadünaamikad individuaalsest varieeruvusest, tuvastades, millal ja kuidas häired, nagu toitumismuudatused, antibiootikumravi või haiguse algus, mikroobikooslust ümber kujundavad.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- Mitme oomika mikrobioomi mitmekesisuse analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Teede rikastumise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonBioinformaatika↔ võrdle
- Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Aegridade RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonBioinformaatika↔ võrdle
Similar methods
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →