Process / pipelineBioinformatics / omics

Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)

Genikogude rikastumise analüüs (GSEA) on arvutusmeetod, mis määrab, kas eelnevalt määratletud geenide kogum – esindades bioloogilist rada, protsessi või funktsiooni – näitab statistiliselt olulisi, koordineeritud erinevusi kahe bioloogilise seisundi vahel. Erinevalt lihtsast voldimuutuse filtreerimisest, töötab GSEA kõigi mõõdetud geenidega, mis on järjestatud korrelatsioonimeetriku järgi, tuvastades peeneid, kuid järjepidevaid nihkeid kogu rajal, isegi kui ükski geen ei ületa olulisuse piirmäära.

Ava rakenduses MethodMindPeagiApply, compare, get guidance

Tools & resources

Laadi slaidid alla

Learn & explore

VideoPeagi

Loe meetodi täielikku kirjeldust

Ainult liikmetele

Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.

Logi sisse

Meetodikaart

Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.

Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)

Multi-omics Gene Set Enr…Võrgupõhine geenikomplek…Teede rikastumise analüüs RNA-seq diferentsiaalne…Üherakulise RNA sekvenee…Bayesian Gene Set Enrich…Bayesian Microbiome Dive…Bayes' meetodite põhjal…Bayesian RNA-seq Differe…Diferentsiaalne ChIP-seq…

+27 veel

Allikad

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Kuidas sellele lehele viidata

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Milline meetod?

Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.

Multi-omics Gene Set Enrichment AnalysisBioinformaatika↔ võrdle
Võrgupõhine geenikomplekti rikastumise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
Teede rikastumise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonBioinformaatika↔ võrdle
Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle

Võrdle kõrvuti →

Sellele viitavad

Bayesian Gene Set Enrichment Analysis Bayesian Microbiome Diversity Analysis Bayes' meetodite põhjal rajanev rajajoonte rikastumise analüüs Bayesian RNA-seq Differential Expression Diferentsiaalne ChIP-seq piikide kutsumine Diferentsiaalne rajajärjestuse rikastumise analüüs eQTL analüüs Masinõppimisega abistatud geenikomplekti rikastamise analüüs Masinõppimisega abistatud rajaprofiili analüüs Masinõppe abil juhitav RNA-seq diferentsiaalavaldise analüüs Masinõppimisega abistatud üksikrakkude RNA-seq analüüs Metaboloomika Analüüs Multi-omics Gene Set Enrichment Analysis Multi-omics metabolomics analysis Mitme oomika mikrobioomi mitmekesisuse analüüs Mitmeomika rajajoonise rikastuse analüüs Multi-oomika proteoomika analüüs Mitme omika andmete RNA-seq diferentsiaalse ekspressiooni analüüs Mitme omiksitehnoloogia üksikrakkude RNA-seq analüüs Võrgustikupõhine koopiaarvuse variatsiooni analüüs Võrgupõhine geenikomplekti rikastumise analüüs Võrgustikupõhine GWAS Võrgustikupõhine metaboloomika analüüs Võrgustikupõhine mikrobioomi mitmekesisuse analüüs Võrgustikupõhine rajateede rikastuse analüüs Võrgustikupõhine RNA-seqi diferentsiaalse ekspressiooni analüüs Võrgupõhine üksikrakkude RNA-seq analüüs Teede rikastumise analüüs Proteoomika analüüs – massispektromeetria-põhine valkude profiilianalüüs RNA-seq diferentsiaalne ekspressioon Ühe raku geenikomplekti rikastumise analüüs Üherakulise RNA sekveneerimise analüüs Single-cell RNA-seq differential expression Aegridade geenikomplekti rikastamise analüüs Aegridade rajaprognooside analüüs Aegridade RNA-seq diferentsiaalne ekspressioon Aegridadega üksikrakkude RNA-seq analüüs

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network Analysis Functional Genomics and Pathway Analysis Gene Ontology and Biological Databases Gene Expression Signatures and Prognostic Markers Transcriptomics and Gene Expression Analysis Systems Genomics and Network Biology

Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →