Single-cell GWAS — rakutüübispetsiifiline geneetilise assotsiatsiooni analüüs
Single-cell GWAS on integreeriv bioinformaatikatorustik, mis kaardistab genoomiülesed assotsiatsiooniuuringu (GWAS) signaalid üksikrakkude transkriptoomilistele maastikele, et tuvastada, millised rakutüübid ja üksikud rakud kannavad ebaproportsionaalselt suurt geneetilist riski haiguse või tunnuse suhtes. Kasutades üksikrakkude RNA-seq atlaseid koos GWAS-i kokkuvõtlike statistiliste andmetega, liigub see edasi kudedetasemel assotsiatsioonidest kaugemale, et paljastada täpsed rakulised kontekstid, milles haigusega seotud geneetilised variandid oma mõju avaldavad.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/single-cell-gwas
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- eQTL analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Genoomiassotsieerimis-uuring (GWAS)Bioinformaatika↔ võrdle
- Teede rikastumise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonBioinformaatika↔ võrdle
- Ühe-raku eQTL analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
Sellele viitavad
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →