Aegridadega üksikrakkude RNA-seq analüüs — ajaline transkriptoomika üksikrakulisel tasemel
Aegridadega üksikrakkude RNA-seq analüüs püüab kinni geeniekspressiooni mitmetes ajapunktides üksikrakulisel tasemel, et paljastada, kuidas rakupopulatsioonid tekivad, muutuvad ja erinevad dünaamiliste bioloogiliste protsesside, nagu areng, diferentseerumine või haiguse progresseerumine, käigus. Kombineerides pseudokorda järjestamist, RNA-kiirust ja diferentsiaaldünaamika testimist, rekonstrueerivad uurijad üksikrakkude ajatrajektoori ja tuvastavad geeniregulatoorsed muutused, mis ajendavad bioloogilisi üleminekuid.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- Kopiarvu variatsiooni analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- eQTL analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)Bioinformaatika↔ võrdle
- Teede rikastumise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonBioinformaatika↔ võrdle
- Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
Sellele viitavad
Similar methods
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →