Process / pipelineBioinformatics / omics

Epigenome-Wide Association Study (EWAS)

Epigenoomi-laiaulatuslik assotsiatsiooniuuring (EWAS) on hüpoteesivaba, genoomi-skaalaga meetod, mis süstemaatiliselt testib, kas epigeneetilised märgid – valdavalt CpG-saidil DNA metülatsioon – erinevad isikute vahel, kellel on teatud tunnus, haigus või kokkupuude, ja kellel seda pole. Skaneerides samaaegselt sadu tuhandeid genoomseid positsioone, tuvastab EWAS lookused, kus epigeneoom on reprodutseeritavalt fenotüübiga seotud, pakkudes bioloogilise regulatsiooni kihti, mida klassikaline GWAS ei suuda haarata.

Ava rakenduses MethodMindPeagiVideoPeagiLaadi slaidid alla

Loe meetodi täielikku kirjeldust

Ainult liikmetele

Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.

Logi sisse

Meetodikaart

Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.

Epigenome-Wide Association Study (EWAS)

ChIP-seq Peak Calling Kopiarvu variatsiooni an…eQTL analüüs Genoomiassotsieerimis-uu…Teede rikastumise analüüs Bayesian ChIP-seq Peak C…Bayesian Epigenome-Wide…Diferentsiaalne ChIP-seq…Diferentsiaalne epigenoo…Masinõppimisega abistatu…

+7 veel

Allikad

Rakyan, V. K., Down, T. A., Balding, D. J., & Beck, S. (2011). Epigenome-wide association studies for common human diseases. Nature Reviews Genetics, 12(8), 529–541. DOI: 10.1038/nrg3000 ↗
Pidsley, R., Zotenko, E., Peters, T. J., Lawrence, M. G., Risbridger, G. P., Molloy, P., Van Djik, S., Muhlhausler, B., Stirzaker, C., & Clark, S. J. (2016). Critical evaluation of the Illumina MethylationEPIC BeadChip microarray for whole-genome DNA methylation profiling. Genome Biology, 17(1), 208. DOI: 10.1186/s13059-016-1066-1 ↗

Kuidas sellele lehele viidata

ScholarGate. (2026, June 3). Epigenome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/epigenome-wide-association-study

Milline meetod?

Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.

ChIP-seq Peak CallingBioinformaatika↔ võrdle
Kopiarvu variatsiooni analüüsBioinformaatika↔ võrdle
eQTL analüüsBioinformaatika↔ võrdle
Genoomiassotsieerimis-uuring (GWAS)Bioinformaatika↔ võrdle
Teede rikastumise analüüsBioinformaatika↔ võrdle

Võrdle kõrvuti →

Sellele viitavad

Bayesian ChIP-seq Peak Calling Bayesian Epigenome-Wide Association Study (Bayesian EWAS)ChIP-seq Peak Calling Kopiarvu variatsiooni analüüs Diferentsiaalne ChIP-seq piikide kutsumine Diferentsiaalne epigenoom-laiune assotsiatsiooniuuring Genoomiassotsieerimis-uuring (GWAS)Masinõppimisega abistatud ChIP-seq piikide kutsumine Mitmeoomika epigenoomi-laiusega assotsiatsiooniuuring Võrgustikupõhine epigenoomi laiusega assotsiatsiooniuuring (Network EWAS)Single-cell ChIP-seq peak calling Ühe-raku epigeneetika-laiaulatuslik assotsiatsiooniuuring (scEWAS)Ajakohaline ChIP-seq tippude kutsumine Aegrid EWAS (time-series Epigenome-wide Association Study)Variant Calling

Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →