HKA test
Hudson-Kreitmani-Aguade (HKA) test on statistiline meetod, mis testib neutraalset evolutsiooni, võrreldes populatsioonisisese polümorfismi ja populatsioonidevahelise divergentsi tasemeid mitmetes lookustes. Hudsoni, Kreitmani ja Aguade poolt 1987. aastal välja töötatud test kasutab põhimõtet, et neutraalsed lookused peaksid näitama oodatavaid seoseid polümorfismi ja divergentsi vahel. Nendest seostest kõrvalekalduvad lookused on valiku kandidaadid. HKA test on eriti kasulik genoomiülese uuringute valiku tuvastamiseks, kuna see kasutab lookuste vahelisi suhtelisi võrdlusi, mitte välist kalibreerimist.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Allikad
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/et/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Koalesentste teooriaGeneetika↔ compare
- F-statistika (FST)Geneetika↔ compare
- McDonald-Kreitmani testGeneetika↔ compare
- Valikulise pühkimise test (Tajima D)Geneetika↔ compare
Sellele viitavad
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →