Ühe raku geenikomplekti rikastumise analüüs — scGSEA
Ühe raku geenikomplekti rikastumise analüüs (scGSEA) laiendab klassikalist hulgi-GSEA-d üksikute rakkude tasemele. Selle asemel, et testida, kas geenikomplekt on rikastunud proovitasandi võrdluses, omistab scGSEA rikastumis- või aktiivsuskoori igaühele rakule, võimaldades teadlastel kaardistada rajade aktiivsust heterogeensete rakupopulatsioonide, rakuseisundite ja arengutrajektooride vahel, mis on jäädvustatud ühe raku RNA-seq andmetes.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- Genikogude rikastumise analüüs (GSEA)Bioinformaatika↔ võrdle
- Teede rikastumise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- RNA-seq diferentsiaalne ekspressioonBioinformaatika↔ võrdle
- Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Single-cell RNA-seq differential expressionBioinformaatika↔ võrdle
Sellele viitavad
Similar methods
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →