Üksikrakkude koopiaarvukuse variatsiooni analüüs
Üksikrakkude koopiaarvukuse variatsiooni (scCNV) analüüs tuvastab genoomsete segmentide suurenemisi ja vähenemisi üksikutes rakkudes, võimaldades teadlastel lahendada intratumori heterogeensust, rekonstrueerida kloonaalset evolutsiooni ja eristada pahaloomulisi rakke normaalsest üksikrakulisel tasemel. Seda saab rakendada otse üksikrakkude kogu genoomi sekveneerimise andmetele või tuletada lugemissügavuse signaalidest scRNA-seq või scATAC-seq eksperimentides.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- Kopiarvu variatsiooni analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Ühe-raku epigeneetika-laiaulatuslik assotsiatsiooniuuring (scEWAS)Bioinformaatika↔ võrdle
- Single-cell GWASBioinformaatika↔ võrdle
- Üherakulise RNA sekveneerimise analüüsBioinformaatika↔ võrdle
- Single-cell RNA-seq differential expressionBioinformaatika↔ võrdle
- Variant CallingBioinformaatika↔ võrdle
Sellele viitavad
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →