PPI võrgu topoloogia
Valgupoolsete interaktsioonide võrgu analüüs tuvastab ja iseloomustab rakuliste interaktsioonivõrkude struktuurseid omadusi. Uetzi ja kolleegide poolt läbimurde saavutanud suuremahulise pärmikahehübriidse sõeltestid, see lähenemisviis paljastab topoloogilisi tunnuseid, nagu sõlmpunktid (hubs), moodulid ja motiivid, mis kodeerivad funktsionaalset organisatsiooni ja haigustega seotud seoseid.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Meetodikaart
Seotud meetodite ümbruskond — vali sõlm, et seda uurida.
Allikad
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/et/bioinformatics/ppi-network-topology
Milline meetod?
Aseta see meetod oma lähimate sugulaste kõrvale ja loe neid kõrvuti — raamatukogu laob raamatud lauale; valik on sinu.
- Krüoelektronmikroskoopia (krüo-EM)Bioinformaatika↔ võrdle
- HMMER profiili otsingBioinformaatika↔ võrdle
- Molekulaarne dokkimineBioinformaatika↔ võrdle
Sellele viitavad
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →