ATAC-seq analüüs
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) on meetod kromatiini ligipääsetavuse maastiku genoomiüleseks profileerimiseks. Buenrostro ja kolleegide poolt 2013. aastal välja töötatud ATAC-seq kasutab hüperaktiivset transposaasi avatud, ligipääsetavate kromatiini piirkondade märgistamiseks, võimaldades kiire ja tundliku regulatoorsete DNA elementide tuvastamist. ATAC-seq on muutunud standardtehnikaks geeniregulatoorsete maastike iseloomustamiseks, rakutüübispetsiifiliste regulatoorsete elementide avastamiseks ja geeniregulatoorsete võrgustike järeldamiseks.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Allikad
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/et/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Hi-C analüüsGeneetika↔ compare
- RNA kiirusGeneetika↔ compare
Sellele viitavad
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →