Hi-C analüüs
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) on tehnika ja sellega seotud arvutusmeetodid genoomi 3D arhitektuuri kaardistamiseks rakkudes. Lieberman-Aideni ja Dekkeri poolt 2009. aastal välja töötatud Hi-C tuvastab füüsilised interaktsioonid genoomsete regioonide vahel, mis võivad lineaarses järjestuses olla kaugel, kuid 3D tuumaruumis ruumiliselt lähedal. Hi-C analüüs on paljastanud genoomi organiseerimise fundamentaalsed põhimõtted, sealhulgas topoloogiliselt assotsieeruvate domeenide (TAD) olemasolu, ning annab ülevaate sellest, kuidas 3D struktuur reguleerib geeniekspressiooni ja DNA replikatsiooni.
Loe meetodi täielikku kirjeldust
Selle osa lugemiseks logi sisse tasuta kontoga.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Allikad
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Kuidas sellele lehele viidata
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/et/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ATAC-seq analüüsGeneetika↔ compare
- RNA kiirusGeneetika↔ compare
Sellele viitavad
Märkasid sellel lehel viga? Teata sellest või paku parandust →