RNA-seq Differential Expression — Analisi DE Trascrittomica

L'analisi dell'espressione differenziale (DE) di RNA-seq identifica geni la cui abbondanza di trascritto differisce significativamente tra due o più condizioni biologiche — ad esempio, trattato contro controllo, o tessuto malato contro sano. Partendo da letture di sequenziamento grezze, la pipeline procede attraverso l'allineamento, la normalizzazione basata sui conteggi, la modellazione statistica della dispersione dei conteggi, il test di ipotesi e la correzione per test multipli per produrre un elenco ordinato di geni differenzialmente espressi accompagnato da stime del fold-change e p-value aggiustati.