Analisi della diversità del microbioma in serie temporali — Analisi della diversità del microbioma longitudinale
L'analisi della diversità del microbioma in serie temporali traccia come la ricchezza, l'uniformità e la composizione della comunità microbica cambiano nel tempo in più punti temporali all'interno degli stessi soggetti. Combinando metriche di diversità standard con modelli statistici longitudinali, separa le vere dinamiche temporali dalla variazione interindividuale, identificando quando e come perturbazioni quali cambiamenti dietetici, trattamento antibiotico o insorgenza di malattie rimodellano il microbioma.
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Fonti
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Come citare questa pagina
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
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- Analisi della Diversità del Microbioma Multi-OmicaBioinformatica↔ confronta
- Analisi di Arricchimento dei PercorsiBioinformatica↔ confronta
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatica↔ confronta
- Analisi RNA-seq a singola cellulaBioinformatica↔ confronta
- Espressione Differenziale RNA-seq in Serie TemporaleBioinformatica↔ confronta
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