Espressione Differenziale RNA-seq in Serie Temporale — Trascrittomica Temporale

L'analisi dell'espressione differenziale (DE) di RNA-seq in serie temporale identifica i geni i cui livelli di espressione cambiano sistematicamente attraverso punti temporali ordinati — come durante lo sviluppo, la progressione di una malattia o la risposta a un trattamento. A differenza dell'analisi DE a due condizioni, essa modella esplicitamente la struttura temporale dei dati, catturando traiettorie dinamiche di espressione genica piuttosto che un singolo contrasto istantaneo. Strumenti come maSigPro, ImpulseDE2 e splineTimeR sono stati sviluppati specificamente per questo tipo di disegno sperimentale.