Analisi RNA-seq a singola cellula — scRNA-seq

L'analisi del sequenziamento dell'RNA a singola cellula (scRNA-seq) caratterizza l'espressione genica alla risoluzione delle singole cellule, consentendo la scoperta di tipi, stati e transizioni cellulari che sono invisibili nella trascrittomica di massa. Partendo dalle letture di sequenziamento grezze, il flusso di lavoro produce una matrice di conteggio cellule per gene e procede attraverso il controllo qualità, la normalizzazione, la riduzione della dimensionalità, il clustering non supervisionato, l'annotazione del tipo cellulare e una serie di analisi a valle come l'inferenza della traiettoria e l'espressione differenziale tra popolazioni cellulari.