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Analisi Bayesiana di Arricchimento di Insiemi di Geni — Punteggio Probabilistico di Percorsi

L'analisi bayesiana di arricchimento di insiemi di geni (Bayesian GSEA) applica un quadro probabilistico per determinare se insiemi predefiniti di geni — che rappresentano percorsi biologici, processi cellulari o categorie funzionali — sono collettivamente espressi in modo differenziale più di quanto atteso per caso. A differenza della classica GSEA frequentista, l'approccio bayesiano modella esplicitamente l'incertezza nelle stime di espressione, incorpora conoscenze biologiche a priori e produce probabilità a posteriori di arricchimento anziché p-value grezzi, consentendo un'inferenza più rigorosa specialmente in contesti con campioni di piccole dimensioni.

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Fonti

  1. Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., ... & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102
  2. Newton, M. A., Quintana, F. A., Den Boon, J. A., Bhattacharya, S., & Ahlquist, P. (2007). Random-set methods identify distinct aspects of the enrichment signal in gene-set analysis. The Annals of Applied Statistics, 1(1), 85-106. link

Come citare questa pagina

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/bayesian-gene-set-enrichment-analysis

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ScholarGateBayesian Gene Set Enrichment Analysis (Bayesian Gene Set Enrichment Analysis). Consultato il 2026-06-15 da https://scholargate.app/it/bioinformatics/bayesian-gene-set-enrichment-analysis · Insieme di dati: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026