Analisi dell'espressione differenziale basata su reti per RNA-seq

L'analisi dell'espressione differenziale basata su reti per RNA-seq integra il test convenzionale dell'espressione differenziale con reti di interazione genica — come grafi di interazione proteina-proteina o reti di co-espressione pesate — per identificare non solo singoli geni differenzialmente espressi, ma moduli genici coerenti e biologicamente significativi che cambiano insieme tra le condizioni. Questo approccio riduce sostanzialmente i falsi positivi e fa emergere segnali a livello di pathway invisibili ai test gene per gene.