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Analisi di Arricchimento di Insiemi di Geni (GSEA)

L'Analisi di Arricchimento di Insiemi di Geni (GSEA) è un metodo computazionale che determina se un insieme predefinito di geni — rappresentante una via biologica, un processo o una funzione — mostra differenze statisticamente significative e coordinate tra due condizioni biologiche. A differenza del semplice filtraggio per fold-change, GSEA opera su tutti i geni misurati, ordinati in base a una metrica di correlazione, rilevando spostamenti sottili ma consistenti in un'intera via, anche quando nessun singolo gene supera una soglia di significatività.

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Fonti

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Come citare questa pagina

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

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