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Analisi di Arricchimento dei Percorsi — Analisi di Arricchimento dei Percorsi Biologici

L'analisi di arricchimento dei percorsi (PEA) è un approccio statistico che prende un elenco di geni o proteine di interesse — tipicamente derivato da un esperimento di espressione differenziale o proteomica — e identifica quali percorsi biologici predefiniti o set di geni funzionali sono rappresentati più spesso del previsto per caso. Mappando le singole modifiche molecolari su basi di conoscenza di percorsi curati come KEGG, Gene Ontology o Reactome, la PEA traduce lunghi elenchi di geni in processi biologici interpretabili, rendendola uno strumento centrale nell'analisi post-sperimentale degli esperimenti omici ad alto rendimento.

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Fonti

  1. Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102
  2. Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140

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ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

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Chiamata Bayesiana dei Picchi ChIP-seqAnalisi Bayesiana degli eQTLAnalisi Bayesiana di Arricchimento di Insiemi di GeniGWAS BayesianoAnalisi Metabolomica BayesianaAnalisi Bayesiana di Arricchimento di PercorsiAnalisi Bayesiana della ProteomicaAnalisi Bayesiana di Espressione Differenziale RNA-seqEpigenome-Wide Association Study DifferenzialeAnalisi Differenziale degli eQTLAnalisi Differenziale di MetabolomicaAnalisi differenziale di arricchimento di pathwayAnalisi Proteomica DifferenzialeStudio di Associazione a Livello di Epigenoma (EWAS)Analisi eQTLAnalisi di Arricchimento di Insiemi di Geni (GSEA)Studio di associazione sull'intero genoma (GWAS)Analisi eQTL assistita da Machine LearningAnalisi di arricchimento di insiemi genici assistita da machine learningAnalisi della diversità del microbioma assistita da Machine LearningAnalisi dell'espressione differenziale RNA-seq assistita da Machine LearningAnalisi di RNA-seq a singola cellula assistita da machine learningAnalisi MetabolomicaStudio di Associazione Epigenoma-Ampio Multi-OmicoAnalisi di Arricchimento di Set di Geni Multi-OmiciAnalisi multi-omica della metabolomicaAnalisi della Diversità del Microbioma Multi-OmicaAnalisi proteomica multi-omicaAnalisi Multi-omica Single-Cell RNA-seqAnalisi basata su rete della variazione del numero di copieEpigenome-Wide Association Study (EWAS) basata su reti (Network EWAS)Analisi eQTL basata su retiAnalisi di Arricchimento di Set di Geni Basata su ReteGWAS basato su retiAnalisi Metabolomica Basata su RetiAnalisi della Diversità del Microbioma Basata su RetiAnalisi dell'espressione differenziale basata su reti per RNA-seqAnalisi di RNA-seq a singola cellula basata su networkAnalisi ProteomicaRNA-seq Differential ExpressionAnalisi eQTL a Singola CellulaSingle-cell Gene Set Enrichment AnalysisGWAS su singola cellulaAnalisi Metabolomica a Singola CellulaAnalisi RNA-seq a singola cellulaAnalisi dell'espressione differenziale di RNA-seq a singola cellulaAnalisi di Arricchimento di Set di Geni in Serie TemporaliAnalisi Metabolomica Serie TemporaleAnalisi della diversità del microbioma in serie temporaliAnalisi di Arricchimento di Percorsi TemporaliEspressione Differenziale RNA-seq in Serie TemporaleAnalisi di RNA-seq unicellulare di serie temporali
ScholarGatePathway Enrichment Analysis (Biological Pathway Enrichment Analysis). Consultato il 2026-06-15 da https://scholargate.app/it/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis · Insieme di dati: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026