Analisi di RNA-seq a singola cellula basata su network
L'analisi di RNA-seq a singola cellula (scRNA-seq) basata su network estende i flussi di lavoro standard di scRNA-seq costruendo e interrogando network di interazione molecolare — network di regolazione genica, network di co-espressione o grafi di comunicazione cellula-cellula — a partire da dati trascrittomici a singola cellula. Anziché trattare ogni gene indipendentemente, questo approccio cattura l'attività coordinata dei circuiti genici e delle vie di segnalazione intercellulare all'interno e tra le popolazioni cellulari, consentendo una visione a livello di sistema della regolazione trascrizionale con risoluzione a singola cellula.
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Fonti
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Come citare questa pagina
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
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